И только одно обстоятельство омрачало их союз. Как императрица, Жозефина была обязана продолжить династию и родить наследника престола. Но оказалось, она не может иметь детей. И медицина была не в силах ей помочь. Жозефина всеми силами пыталась удержать возле себя Наполеона, который стал поговаривать о разводе. Она обращалась не только к врачам, но также и к целителям и гадалкам. Но никто не мог помочь великой и несчастной Жозефине. Наполеон продолжал убеждать Жозефину в необходимости развода с той целью, чтобы создать новый брак во имя Империи, в котором будет рожден наследник. Жозефина два года провела в слезах и стремилась добиться невозможного.К этому времени дети Жозефины были устроены. Сын Евгений стал вице-королем Италии и принцем Венеции, а дочь Гортензия стала супругой брата Бонапарта, ставшего королем Голландии. Устав от борьбы, Императрицаимператрица, наконец, дала согласие на развод. Но она поставила условие - сохранить за ней титул и получить соответствующее содержание, включая собственный двор.
Жозефина и Наполеон развелись 16 декабря 1809 года. Император после этого сочетался браком с австрийской принцессой Марией-Луизой. Она в 1811 родила ему желанного наследника. Жозефина после развода стала императрицей – консортом. Наличие титула не подразумевало сохранение императорской власти. Интересно, что между ней и Наполеоном сохранились хорошие отношения. Они постоянно переписывались, хоть встречались редко.
Она поселилась недалеко от Парижа во дворце Мальмезон. Этот дворец ей подарил Наполеон. Она провела в этом дворце остаток жизни. Великая женщина увлекалась выращиванием экзотических растений, коллекционированием произведением произведений искусств. Она собрала отличную коллекцию картин и скульптур.
Впоследствии часть их оказалась в России. Ее коллекцией живописи заинтересовался российский император Александр I. Он посетил Жозефину в Мальмезоне В в 1814 году. После ее смерти он приобрел 38 картин и 4 скульптуры.Жозефина ушла из жизни 29 мая 1814 года, через четыре с половиной года после развода с мужем, храня любовь к Наполеону в своем сердце. Ее похоронили в местном соборе, а над могилой установили изящное надгробие.
Существует предание, что Наполеон, умирая в одиночестве на острове св. Елены, прошептал такие слова: «Армия. Франция. Наполеон и Жозефина».